不幸的是，有很多人認爲，以錯誤的方式食用益生菌推薦兒童的。
菌體是人類腸道的好細菌來源.
人類的腸道中生活着無數的微生物，而其中的益生菌可以防止致病菌的生長。定期使用益生菌可以協助解決胃腸道問題，促進腸道蠕動，提高免疫力。儘管不是每個人都應該服用益生菌，但在某些情況下應該避免服用。例如，嚴重的胃腸道潰瘍有出血的風險（如果腸道或十二指腸內壁受損，細菌可能會滲入血液）。接受化療的病人應避免食用益生菌，因爲這樣做會造成免疫抑制。另一方面，化療可能導致白血球大幅下降，這可能導致免疫力下降。
麻疹患者有不同程度的細菌功能障礙和生物脂質內分泌出血
攝取益生菌可能有助於平衡腸道中好細菌和壞細菌的比例，並通過確保飲食中不能喫到足夠膳食纖維的人不患便祕而改善腸道健康。如果你有便祕或腹瀉（由細菌或病毒引起的感染性腹瀉或非感染性腹瀉），攝入益生菌可能有助於平衡腸道中好菌和壞菌的比例。乳糜瀉患者患有不同程度的菌羣失調和生脂內毒素血癥。腸道中產生胺的腐敗細菌可以用益生菌來抑制，降低腸道的酸度和血液中的內毒素水平。
乳腺炎患者體內好壞的微生物存在不平衡
乳糜瀉患者的腸道內好菌和壞菌不平衡，出現菌羣失調和生脂內毒素血癥（Shankar和Sparkman，2012）。一個人可能得不到足夠的膳食纖維，導致便祕，特別是如果他們一天三餐都在外面喫。使用益生菌可以幫助維持腸道健康，並通過平衡好菌和壞菌的比例來預防便祕（Shankar and Sparkman, 2012）。如果你有腹瀉（感染或不感染）或由細菌或病毒引起的腹瀉，服用益生菌也可以預防便祕（Shankar and Sparkman, 2012）。
